Protein–RNA interactions for Protein: Q3U435

Mmp25, Matrix metalloproteinase-25, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp25Q3U435 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp25Q3U435 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp25Q3U435 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms