Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gse1Q3U3C9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gse1Q3U3C9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms