Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec24aQ3U2P1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms