Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc9Q3U0M1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc9Q3U0M1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms