Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy4Q3TYX8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy4Q3TYX8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms