Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf6Q3TWW8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf6Q3TWW8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf6Q3TWW8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf6Q3TWW8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Srsf6Q3TWW8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms