Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpgp1Q3TLS3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms