Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEA8

Hp1bp3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hp1bp3Q3TEA8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hp1bp3Q3TEA8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms