Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Shroom4Q1W617 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Shroom4Q1W617 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Shroom4Q1W617 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Shroom4Q1W617 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Shroom4Q1W617 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Shroom4Q1W617 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
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Shroom4Q1W617 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shroom4Q1W617 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
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Shroom4Q1W617 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
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