Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam171bQ14CH0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Fam171bQ14CH0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Fam171bQ14CH0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Fam171bQ14CH0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam171bQ14CH0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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