Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli2Q0VGT2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms