Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc162pQ0VG85 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms