Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne7Q0VE82 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms