Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NeblQ0II04 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NeblQ0II04 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NeblQ0II04 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NeblQ0II04 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NeblQ0II04 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NeblQ0II04 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NeblQ0II04 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NeblQ0II04 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NeblQ0II04 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NeblQ0II04 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms