Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc21bQ0HA38 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc21bQ0HA38 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms