Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700061G19RikQ08EE8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms