Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cass4Q08EC4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cass4Q08EC4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms