Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssrp1Q08943 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms