Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms