Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox4Q06831 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms