Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sh3bp2Q06649 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh3bp2Q06649 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms