Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcad1Q04692 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms