Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nf1Q04690 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nf1Q04690 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms