Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcr5Q04683 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms