Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Runx1Q03347 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Runx1Q03347 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms