Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hivep1Q03172 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hivep1Q03172 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms