Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddr1Q03146 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms