Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fgfr4Q03142 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fgfr4Q03142 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms