Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha4Q03137 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epha4Q03137 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms