Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nhlh1Q02576 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms