Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sec23aQ01405 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sec23aQ01405 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms