Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Grin2cQ01098 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin2cQ01098 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms