Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga4Q00651 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms