Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp9bP98195 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp9bP98195 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms