Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VldlrP98156 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VldlrP98156 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VldlrP98156 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms