Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig3P97386 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lig3P97386 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms