Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Arf1P84078 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Arf1P84078 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Arf1P84078 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Arf1P84078 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Arf1P84078 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Arf1P84078 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Arf1P84078 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms