Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx2P80206 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx2P80206 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms