Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx1P80205 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx1P80205 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Otx1P80205 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms