Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr4P70658 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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