Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf11P70378 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms