Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux2P70298 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux2P70298 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux2P70298 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux2P70298 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux2P70298 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux2P70298 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux2P70298 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux2P70298 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux2P70298 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux2P70298 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cux2P70298 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cux2P70298 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cux2P70298 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cux2P70298 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cux2P70298 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms