Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Abcc9P70170 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Abcc9P70170 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Abcc9P70170 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Abcc9P70170 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms