Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps17P63276 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps17P63276 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps17P63276 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms