Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr2lP62876 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Polr2lP62876 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms