Protein–RNA interactions for Protein: P62500

Tsc22d1, TSC22 domain family protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d1P62500 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tsc22d1P62500 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc22d1P62500 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms