Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rps29P62274 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rps29P62274 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
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