Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufm1P61961 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufm1P61961 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms