Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx1bP61264 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stx1bP61264 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx1bP61264 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms