Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Snap25P60879 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snap25P60879 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Snap25P60879 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Snap25P60879 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms